En 1979 Juan Gastó se incorporó a la Faculta de Agronomía e Ingeniería Forestal de la Pontificia Universidad Católica de Chile, donde dicta las asignaturas de Ecología, Manejo de Praderas, Conservación y Manejo de Recursos Naturales, Praderas Nativas de Chile y Taller de Ecosistemas, participando adicionalmente en el curso Principios de la Investigación y Filosofía de la Ciencia y en el Magíster de Asentamientos Urbanos del Instituto de Estudios Urbanos.

Como apoyo a la labor de docencia e investigación el profesor Gastó implementó en esta institución el Laboratorio de Ecosistemas del Departamento de Ciencias Animales de la Facultad de Agronomía e Ingeniería Forestal, un laboratorio clínico enfocado en la aplicación de la Metodología clínica de Ecosistemas (ver el libro Ecología, el hombre y la transformación de la naturaleza, 1979), en que se describe, organiza y analiza la información de los predios estudiados en las salidas a terreno, incluyendo la arquitectura, funcionamiento y sistemogénesis de los ecosistemas, para luego hacer un diagnóstico y diseñar soluciones, orientadas al ordenamiento del paisaje y el cumplimiento de las funciones armónicas de la naturaleza y de la productividad. Esta forma de trabajo también puede apreciarse en el libro de Ordenación territorial, Desarrollo de predios y comunas rurales, en el capítulo de Metodología para la representación y resolución de problemas en predios rurales.

Laboratorio de Ecosistemas